Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms