Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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TCF23Q7RTU1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TCF23Q7RTU1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TCF23Q7RTU1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TCF23Q7RTU1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TCF23Q7RTU1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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