Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC36A4Q6YBV0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC36A4Q6YBV0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms