Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms