Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM46CQ5VWP2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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