Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LRRC38Q5VT99 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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LRRC38Q5VT99 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC38Q5VT99 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC38Q5VT99 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC38Q5VT99 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC38Q5VT99 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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