Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms