Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms