Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms