Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETM2Q2VYF4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms