Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHQ16836 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms