Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms