Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD2Q16342 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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