Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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