Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms