Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SCN9AQ15858 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SCN9AQ15858 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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