Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms