Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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