Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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