Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms