Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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