Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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