Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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