Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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