Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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