Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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