Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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