Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RPL5P28-201ENST00000418634 693 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PDE4D-209ENST00000502575 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC095050.1-201ENST00000502661 905 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC093334.1-201ENST00000559904 423 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC011939.1-201ENST00000567680 964 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC133528.1-201ENST00000608316 805 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CLEC12B-201ENST00000338896 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC006042.1-201ENST00000449931 524 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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