Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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