Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.77e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 EMC4-205ENST00000558102 543 ntTSL 219.32■□□□□ 0.684e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CSNK1D-224ENST00000584672 401 ntTSL 317.64■□□□□ 0.415e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MRPL2-209ENST00000491898 1020 ntTSL 217.54■□□□□ 0.44e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MRPL2-205ENST00000480286 661 ntTSL 217.39■□□□□ 0.374e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SLIRP-207ENST00000556831 729 ntTSL 216.88■□□□□ 0.295e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 AUP1-205ENST00000464887 845 ntTSL 216.78■□□□□ 0.287e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA1-213ENST00000533068 571 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.115e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 215.7■□□□□ 0.15e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.077e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ATP5H-205ENST00000582341 979 ntTSL 214.59□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 RTN4-211ENST00000438462 656 ntTSL 514.39□□□□□ -0.113e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CIZ1-223ENST00000491954 955 ntTSL 314.26□□□□□ -0.131e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MRPL2-204ENST00000470667 765 ntTSL 514.06□□□□□ -0.164e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.167e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 NQO2-206ENST00000380472 689 ntTSL 513.68□□□□□ -0.227e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MRPL2-203ENST00000468957 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.294e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 TGS1-201ENST00000260129 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.337e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 512.69□□□□□ -0.387e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CCNB2-204ENST00000561077 687 ntTSL 512.4□□□□□ -0.424e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.617e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 HMGN1-201ENST00000288344 1303 ntTSL 210.89□□□□□ -0.673e-18■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.677e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CIZ1-224ENST00000498156 642 ntTSL 510.82□□□□□ -0.681e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 TGS1-203ENST00000523948 3159 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.697e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA1-211ENST00000531156 574 ntTSL 410.72□□□□□ -0.691e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ABCE1-201ENST00000296577 3921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 NQO2-208ENST00000426637 626 ntTSL 59.63□□□□□ -0.877e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 29.54□□□□□ -0.883e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SNRPB2-201ENST00000246071 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.947e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SNAP23-220ENST00000568841 632 ntTSL 39.18□□□□□ -0.947e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.944e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CIZ1-214ENST00000474442 457 ntTSL 48.95□□□□□ -0.981e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.158e-9■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.188e-9■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GYPA-207ENST00000510771 709 ntTSL 37.66□□□□□ -1.181e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.231e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SNAP23-208ENST00000563830 570 ntTSL 57.18□□□□□ -1.267e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GLS-206ENST00000412247 693 ntTSL 37.06□□□□□ -1.285e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.297e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ATP5H-203ENST00000538432 533 ntTSL 36.89□□□□□ -1.311e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SNAP23-209ENST00000563873 368 ntTSL 36.75□□□□□ -1.337e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA3-212ENST00000557290 730 ntTSL 26.57□□□□□ -1.368e-9■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.367e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GLS-208ENST00000457316 821 ntTSL 46.5□□□□□ -1.375e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 26.42□□□□□ -1.382e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.515e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.578e-9■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA1-214ENST00000533331 575 ntTSL 45.08□□□□□ -1.61e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.637e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA3-204ENST00000553677 363 ntTSL 54.79□□□□□ -1.648e-9■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CDC27-211ENST00000570740 594 ntTSL 54.32□□□□□ -1.724e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.794e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.871e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.241e-18■□□□□ 8
PABPC4Q13310 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.081e-18■□□□□ 8
PABPC4Q13310 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-18■□□□□ 8
PABPC4Q13310 HINT1-202ENST00000504202 619 ntTSL 54.42□□□□□ -1.71e-18■□□□□ 8
PABPC4Q13310 TPM1-228ENST00000560975 2855 ntTSL 517.74■□□□□ 0.437e-11■□□□□ 8
PABPC4Q13310 TPM1-209ENST00000558072 525 ntTSL 214.38□□□□□ -0.117e-11■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SNRPC-204ENST00000474635 511 ntTSL 510.36□□□□□ -0.757e-11■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MRPS22-206ENST00000480644 363 ntTSL 35.19□□□□□ -1.587e-11■□□□□ 8
PABPC4Q13310 HINT1-210ENST00000520028 82 ntTSL 35.97□□□□□ -1.456e-36■□□□□ 8
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