Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SRSF6Q13247 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SRSF6Q13247 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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