Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms