Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1AQ13111 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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