Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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