Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms