Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms