Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms