Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms