Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms