Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms