Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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