Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX1P83916 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CBX1P83916 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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