Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CACNG7P62955 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms