Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms