Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOSBP53539 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOSBP53539 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOSBP53539 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOSBP53539 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms