Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms