Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF140P52738 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF140P52738 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF140P52738 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF140P52738 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF140P52738 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF140P52738 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF140P52738 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF140P52738 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms