Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms