Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA1P42261 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms