Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL4AP40617 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms